Publications

26 items matching your search terms.

Spatial deconvolution of HER2-positive breast cancer delineates tumor-associated cell type interactions

Andersson, A.; Larsson, L.; Stenbeck, L.; Salmen, F.; Ehinger, A.; Wu, S. Z.; Al-Eryani, G.; Roden, D.; Swarbrick, A.; Borg, A.; Frisen, J.; Engblom, C.; Lundeberg, J.

Nature Communications 12 (1) :6012, 2021 10.1038/s41467-021-26271-2

A single-cell and spatially resolved atlas of human breast cancers

Wu, S. Z.; Al-Eryani, G.; Roden, D. L.; Junankar, S.; Harvey, K.; Andersson, A.; Thennavan, A.; Wang, C.; Torpy, J. R.; Bartonicek, N.; Wang, T.; Larsson, L.; Kaczorowski, D.; Weisenfeld, N. I.; Uytingco, C. R.; Chew, J. G.; Bent, Z. W.; Chan, C. L.; Gnanasambandapillai, V.; Dutertre, C. A.; Gluch, L.; Hui, M. N.; Beith, J.; Parker, A.; Robbins, E.; Segara, D.; Cooper, C.; Mak, C.; Chan, B.; Warrier, S.; Ginhoux, F.; Millar, E.; Powell, J. E.; Williams, S. R.; Liu, X. S.; O'Toole, S.; Lim, E.; Lundeberg, J.; Perou, C. M.; Swarbrick, A.

NATURE GENETICS 53 (9) :1334-1347, 2021 10.1038/s41588-021-00911-1

Cross-tissue single-cell landscape of human monocytes and macrophages in health and disease

Mulder, K.; Patel, A. A.; Kong, W. T.; Piot, C.; Halitzki, E.; Dunsmore, G.; Khalilnezhad, S.; Irac, S. E.; Dubuisson, A.; Chevrier, M.; Zhang, X. M.; Tam, J. K. C.; Lim, T. K. H.; Wong, R. M. M.; Pai, R.; Khalil, A. I. S.; Chow, P. K. H.; Wu, S. Z.; Al-Eryani, G.; Roden, D.; Swarbrick, A.; Chan, J. K. Y.; Albani, S.; Derosa, L.; Zitvogel, L.; Sharma, A.; Chen, J.; Silvin, A.; Bertoletti, A.; Bleriot, C.; Dutertre, C. A.; Ginhoux, F.

IMMUNITY 54 (8) :1883-1900 e5, 2021 10.1016/j.immuni.2021.07.007

Cryopreservation of human cancers conserves tumour heterogeneity for single-cell multi-omics analysis

Wu, S. Z.; Roden, D. L.; Al-Eryani, G.; Bartonicek, N.; Harvey, K.; Cazet, A. S.; Chan, C. L.; Junankar, S.; Hui, M. N.; Millar, E. A.; Beretov, J.; Horvath, L.; Joshua, A. M.; Stricker, P.; Wilmott, J. S.; Quek, C.; Long, G. V.; Scolyer, R. A.; Yeung, B. Z.; Segara, D.; Mak, C.; Warrier, S.; Powell, J. E.; O'Toole, S.; Lim, E.; Swarbrick, A.

Genome Medicine 13 (1) :81, 2021 10.1186/s13073-021-00885-z

Single-cell transcriptomics reveals involution mimicry during the specification of the basal breast cancer subtype

Valdes-Mora, F.; Salomon, R.; Gloss, B. S.; Law, A. M. K.; Venhuizen, J.; Castillo, L.; Murphy, K. J.; Magenau, A.; Papanicolaou, M.; Rodriguez de la Fuente, L.; Roden, D. L.; Colino-Sanguino, Y.; Kikhtyak, Z.; Farbehi, N.; Conway, J. R. W.; Sikta, N.; Oakes, S. R.; Cox, T. R.; O'Donoghue, S. I.; Timpson, P.; Ormandy, C. J.; Gallego-Ortega, D.

Cell Reports 35 (2) :108945, 2021 10.1016/j.celrep.2021.108945

The androgen receptor is a tumor suppressor in estrogen receptor-positive breast cancer

Hickey, T. E.; Selth, L. A.; Chia, K. M.; Laven-Law, G.; Milioli, H. H.; Roden, D.; Jindal, S.; Hui, M.; Finlay-Schultz, J.; Ebrahimie, E.; Birrell, S. N.; Stelloo, S.; Iggo, R.; Alexandrou, S.; Caldon, C. E.; Abdel-Fatah, T. M.; Ellis, I. O.; Zwart, W.; Palmieri, C.; Sartorius, C. A.; Swarbrick, A.; Lim, E.; Carroll, J. S.; Tilley, W. D.

NATURE MEDICINE 27 (2) :310-320, 2021 10.1038/s41591-020-01168-7

Inhibitor of Differentiation 4 (ID4) represses mammary myoepithelial differentiation via inhibition of HEB

Holliday, H.; Roden, D.; Junankar, S.; Wu, S. Z.; Baker, L. A.; Krisp, C.; Chan, C. L.; McFarland, A.; Skhinas, J. N.; Cox, T. R.; Pal, B.; Huntington, N. D.; Ormandy, C. J.; Carroll, J. S.; Visvader, J.; Molloy, M. P.; Swarbrick, A.

iScience 24 (2) :102072, 2021 10.1016/j.isci.2021.102072

Stromal cell diversity associated with immune evasion in human triple-negative breast cancer

Wu, S. Z.; Roden, D. L.; Wang, C.; Holliday, H.; Harvey, K.; Cazet, A. S.; Murphy, K. J.; Pereira, B.; Al-Eryani, G.; Bartonicek, N.; Hou, R.; Torpy, J. R.; Junankar, S.; Chan, C. L.; Lam, C. E.; Hui, M. N.; Gluch, L.; Beith, J.; Parker, A.; Robbins, E.; Segara, D.; Mak, C.; Cooper, C.; Warrier, S.; Forrest, A.; Powell, J.; O'Toole, S.; Cox, T. R.; Timpson, P.; Lim, E.; Liu, X. S.; Swarbrick, A.

EMBO JOURNAL 1 (39) :e104063, 2020 10.15252/embj.2019104063

Targeting the Id1-Kif11 Axis in Triple-Negative Breast Cancer Using Combination Therapy

Thankamony, A. P.; Murali, R.; Karthikeyan, N.; Varghese, B. A.; Teo, W. S.; McFarland, A.; Roden, D. L.; Holliday, H.; Konrad, C. V.; Cazet, A.; Dodson, E.; Yang, J.; Baker, L. A.; George, J. T.; Levine, H.; Jolly, M. K.; Swarbrick, A.; Nair, R.

Biomolecules 10 (9) :E1295, 2020 10.3390/biom10091295

Id Proteins Promote a Cancer Stem Cell Phenotype in Mouse Models of Triple Negative Breast Cancer via Negative Regulation of Robo1

Teo, W. S.; Holliday, H.; Karthikeyan, N.; Cazet, A. S.; Roden, D. L.; Harvey, K.; Konrad, C. V.; Murali, R.; Varghese, B. A.; Thankamony, A. P.; Chan, C. L.; McFarland, A.; Junankar, S.; Ye, S.; Yang, J.; Nikolic, I.; Shah, J. S.; Baker, L. A.; Millar, E. K. A.; Naylor, M. J.; Ormandy, C. J.; Lakhani, S. R.; Kaplan, W.; Mellick, A. S.; O'Toole, S. A.; Swarbrick, A.; Nair, R.

Frontiers in Cell and Developmental Biology 8 :552, 2020 10.3389/fcell.2020.00552

Proteogenomic analysis of Inhibitor of Differentiation 4 (ID4) in basal-like breast cancer

Baker, L. A.; Holliday, H.; Roden, D.; Krisp, C.; Wu, S. Z.; Junankar, S.; Serandour, A. A.; Mohammed, H.; Nair, R.; Sankaranarayanan, G.; Law, A. M. K.; McFarland, A.; Simpson, P. T.; Lakhani, S.; Dodson, E.; Selinger, C.; Anderson, L.; Samimi, G.; Hacker, N. F.; Lim, E.; Ormandy, C. J.; Naylor, M. J.; Simpson, K.; Nikolic, I.; O'Toole, S.; Kaplan, W.; Cowley, M. J.; Carroll, J. S.; Molloy, M.; Swarbrick, A.

BREAST CANCER RES 22 (1) :63, 2020 10.1186/s13058-020-01306-6

Prostate cancer cell-intrinsic interferon signaling regulates dormancy and metastatic outgrowth in bone

Owen, K. L.; Gearing, L. J.; Zanker, D. J.; Brockwell, N. K.; Khoo, W. H.; Roden, D. L.; Cmero, M.; Mangiola, S.; Hong, M. K.; Spurling, A. J.; McDonald, M.; Chan, C. L.; Pasam, A.; Lyons, R. J.; Duivenvoorden, H. M.; Ryan, A.; Butler, L. M.; Mariadason, J. M.; Giang Phan, T.; Hayes, V. M.; Sandhu, S.; Swarbrick, A.; Corcoran, N. M.; Hertzog, P. J.; Croucher, P. I.; Hovens, C.; Parker, B. S.

EMBO REPORTS 21 (6) :e50162, 2020 10.15252/embr.202050162

ELF5 modulates the estrogen receptor cistrome in breast cancer

Piggin, C. L.; Roden, D. L.; Law, A. M. K.; Molloy, M. P.; Krisp, C.; Swarbrick, A.; Naylor, M. J.; Kalyuga, M.; Kaplan, W.; Oakes, S. R.; Gallego-Ortega, D.; Clark, S. J.; Carroll, J. S.; Bartonicek, N.; Ormandy, C. J.

PLoS Genetics 16 (1) :e1008531, 2020 10.1371/journal.pgen.1008531

CAF hierarchy driven by pancreatic cancer cell p53-status creates a pro-metastatic and chemoresistant environment via perlecan

Vennin, C.; Melenec, P.; Rouet, R.; Nobis, M.; Cazet, A. S.; Murphy, K. J.; Herrmann, D.; Reed, D. A.; Lucas, M. C.; Warren, S. C.; Elgundi, Z.; Pinese, M.; Kalna, G.; Roden, D.; Samuel, M.; Zaratzian, A.; Grey, S. T.; Da Silva, A.; Leung, W.; Mathivanan, S.; Wang, Y.; Braithwaite, A. W.; Christ, D.; Benda, A.; Parkin, A.; Phillips, P. A.; Whitelock, J. M.; Gill, A. J.; Sansom, O. J.; Croucher, D. R.; Parker, B. L.; Pajic, M.; Morton, J. P.; Cox, T. R.; Timpson, P.

Nature Communications 10 (1) :3637, 2019 10.1038/s41467-019-10968-6

High-throughput targeted long-read single cell sequencing reveals the clonal and transcriptional landscape of lymphocytes

Singh, M.; Al-Eryani, G.; Carswell, S.; Ferguson, J. M.; Blackburn, J.; Barton, K.; Roden, D.; Luciani, F.; Giang Phan, T.; Junankar, S.; Jackson, K.; Goodnow, C. C.; Smith, M. A.; Swarbrick, A.

Nature Communications 10 (1) :3120, 2019 10.1038/s41467-019-11049-4

A Niche-Dependent Myeloid Transcriptome Signature Defines Dormant Myeloma Cells

Khoo, W. H.; Ledergor, G.; Weiner, A.; Roden, D. L.; Terry, R. L.; McDonald, M. M.; Chai, R. C.; De Veirman, K.; Owen, K. L.; Opperman, K. S.; Vandyke, K.; Clark, J. R.; Seckinger, A.; Kovacic, N.; Nguyen, A.; Mohanty, S. T.; Pettitt, J. A.; Xiao, Y.; Corr, A. P.; Seeliger, C.; Novotny, M.; Lasken, R. S.; Nguyen, T. V.; Oyajobi, B. O.; Aftab, D.; Swarbrick, A.; Parker, B.; Hewett, D. R.; Hose, D.; Vanderkerken, K.; Zannettino, A. C. W.; Amit, I.; Phan, T. G.; Croucher, P. I.

Blood 134 (1) :30-43, 2019 10.1182/blood.2018880930